Riesige Gebiete urzeitlichen Dschungels bedecken die Inseln Raja Ampats und beherbergen Orchideen, Beuteltiere, Paradiesvögel, Nashornvögel, Kakadus und vieles mehr. Die Steilwände sind mit allen Arten von Weich- und Hartkorallen bewachsen. Das Gebiet befindet sich im berühmten Korallendreieck und den Highlights zählen Büffelköpfe, Schildkröten, Mantas sowie einigen seltenen Haiarten und jede Menge Makro. Wer Glück hat, kann Delphine und Wale beobachten und vielleicht sogar mit ihnen schnorcheln.  Die Cenderawasih Bay ist für ihre häufigen Walhaisichtungen an Fischerei Plattformen berühmt geworden - das ist allerdings nur etwas für echte Abenteurer da sehr entlegen und nur im Rahmen einer Tauchkreuzfahrt erreichbar.
Raja Ampat ist das ganze Jahr über betauchbar. Die meisten Tauchkreuzfahrtschiffe cruisen hier nur in den Wintermonaten, aufgrund der Äquatornähe ist es aber auch im Sommer schön und .. man trifft nur noch die Taucher der Resorts an den Tauchspots!